https://frosthead.com

Popis druhu prvního obratlovce s čárovým kódem DNA

V prosinci 1982 Benjamin Victor, zakladatel výzkumné iniciativy pro korálový útes Ocean Science Foundation, potápěl v útesu, který se právě nacházel v terénní stanici Smithsonian Tropical Research Institute, když nabral dospělého goby. Ryba vypadala mírně odlišně od svého atlantického goby, ale jeho rysy nebyly natolik jedinečné, aby to prohlásily za nový druh.

Victor měl podezření, že rozdíly probíhají hluboko v gobyho genetickém složení, ale systém identifikace druhů, založený pouze na fyzických identifikátorech, jako jsou označení, počet ploutví a tvarů kostí, ho zklamal. Potřeboval by druhý vzorek a analýzu DNA. Vzorek tedy seděl a seděl - vlastně na Victorově stole - téměř 25 let.

V březnu 2006 shromáždil Dave Jones z National Marine Fisheries Service larvální exemplář připomínající Viktorovy goby v pasti z mexického Yucatanu. Odtamtud nová taxonomická technika čárového kódování umožnila Viktorovi sladit DNA larvy s dospělým a prohlásit goby za nový druh, který se od svých atlantických goby příbuzných odchýlí o neuvěřitelných 25 procent (mějte na paměti: lidé a šimpanzi se liší jen o 1-2 procenta).

Ryba tvrdí, že sláva je taková, že její identita byla přibita čárovým kódem DNA. Čárový kód, převzatý z dohodnutého místa v genomu, se chová jako čárový kód spotřebního produktu, protože uzavírá dohodu z hlediska identifikace.

Goby se jmenoval Coryphopterus kuna a stal se prvním druhem obratlovců, který má v oficiálním popisu druhu svůj čárový kód DNA. Čárovým kódem bylo asi 30 000 známých druhů, od hub po ptáky, ale ve všech případech byly tyto druhy nalezeny a vědecky popsány před vytvořením čárových kódů. Iniciativa čárového kódu života, jejíž je Smithsonianova instituce partnerem, naléhavě žádá, aby byly krátké řetězce DNA shromážděny a umístěny do otevřené databáze.

„Neexistoval žádný způsob, jak usnadnit a konzistentní identifikaci ryb. Obvykle jste museli být expertem a museli byste mít dobrý dospělý vzorek, který byste měli prozkoumat, a pak to byl váš názor, “ říká Victor pre-barcoding z taxonomie. "Nyní může kdokoli, kdo má přístup k technologii čárových kódů, určitě říci, že sekvence odpovídá druhu X, i když máte vajíčko, larvu nebo měřítko nebo kousek kůže."

(Se svolením STRI)

Popis druhu prvního obratlovce s čárovým kódem DNA