Není pochyb o tom, že mikroskopické vodní bezobratlí, známí jako tardigradi, mechová selata nebo vodní medvědi, jsou divní. Mimořádně rozkošná zvířátka mohou přežít vakuum vesmíru, vydržet vysychání suchem a po zmrazení se objevit naživu, mimo jiné i ve hře. Nedávná studie naznačuje, že tardigrades jsou také geny pro krádeže genů - že jejich genomy obsahují více DNA z nepříbuzných rostlin, bakterií a jiných mikrobů než kterékoli jiné zvíře na Zemi, Rachel Nuwerová nedávno uvedla pro Smithsonian.com . Tato schopnost by mohla dokonce vysvětlit, proč jsou tardigrades tak odolní, tvrdí vědci.
Ale asi týden po oznámení tohoto překvapivého objevu jiná skupina napadla zjištění, hlásí Ed Yong pro Atlantik . Rychlý postup vpřed a vzad mezi oběma týmy ukazuje, jak citlivá a potenciálně seberealizující věda může být v digitálním věku.
První studie týmu z Univerzity v Severní Karolíně uvedla, že jeden druh tardigrádu nese neuvěřitelných 6 600 genů, které původně patřily organismům z jiných království - většinou bakterií, ale také hub, rostlin, virů a archaea a získaných prostřednictvím proces zvaný horizontální přenos genů. Tato zjištění znamenala, že genom Hypsibius dujardini je složen z asi 17, 5 procent cizí DNA, uvedl tým ve sborníku Národní akademie věd . Protože některé cizí geny jsou zapojeny do stresových reakcí jiných organismů, vědci mají podezření, že by mohli mít tardigrades s některými svými vlastními jedinečnými schopnostmi k povětrnostním extrémním podmínkám.
Druhá skupina z University of Edinburgh však také sekvenovala stejné druhy tardigrade a získala velmi odlišné výsledky. Tito vědci zjistili, že zvíře má mezi 36 a 500 horizontálně přenesenými geny - mnohem menší procento. Když vyšel dokument UNC, výsledky v Edinburghu byly stále nepublikovány, ale vědci se snažili zveřejnit svá zjištění na serveru předtisku bioRxiv.org - webové stránce, kde mohou být rukopisy zveřejněny před jejich odesláním do deníku a vzájemným hodnocením typickým pro vědecký výzkum.
Skupina Edinburghu má podezření, že skupina UNC mohla „sekvencovat DNA z bakterií, které žily vedle tardigradů, a navzdory svému nejlepšímu úsilí si mýlil geny těchto mikrobů za skutečné tardigrade geny“, píše Yong. Jak ale mohla být první skupina zaměněna, pokud ano? Yong vysvětluje, že technologie pro sekvenování genomů zahrnuje sekání DNA na malé kousky a poté opětovné sestavení bitů do souvislého obrazu. Nějaká kontaminace se může snadno vklouznout, takže vědci se snaží zjistit, které kousky patří k organismu, který studují, spíše než mikroby poblíž.
Skupina Edinburghu si uvědomila, že některé fragmenty DNA byly ve srovnání s jinými fragmenty vzácné. „Neexistuje způsob, jak by biologicky mohly být součástí stejného genomu, “ říká vedoucí týmu Mark Blaxter Yong. Skupina dospěla k závěru, že v genomu tardigrade je 500 genů, které by mohly pocházet z jiných zdrojů, ale mají pouze silné důkazy pro 36 z nich. To dává tardigrade mnohem typičtější podíl cizí DNA pro zvíře.
V komentáři k nejnovějšímu článku Thomas Boothby a Bob Goldstein z UNC poukazují na to, že si byli vědomi tohoto potenciálního problému a tvrdě pracovali, aby zajistili, že to neovlivní jejich výsledky - ale že vždy existuje možnost chyby. Dodávají, že před dalším komentářem provedou další analýzu. Vědci také uvedli, že ocenili rozhodnutí svých soupeřů zveřejnit své protichůdné výsledky tak rychle na bioRxiv.org .
Pocity byly vzájemné. Sujai Kumar z edinburského týmu Yong řekl, že kdyby skupina UNC nezveřejnila svá data rychle, bylo by to pro jejich skupinu náročnější. „Je zřejmé, že je úžasná nová schopnost vědy rychle se napravit, “ říká Blaxter Yong. To, co by v tomto případě trvalo pouhých devět dní, by v minulosti trvalo měsíce.
V současné době porota stále zkoumá, kolik genomu tardigradu pochází z cizích zdrojů. Ale i když tato drobná stvoření nejsou genovými zloději, mohou být na chvíli delší tuláci.
Poznámka redaktorů: Tento článek byl editován Rachel Nuwerovou, která původně informovala o výzkumu tardigrade na Smithsonian.com.
