https://frosthead.com

Ambiciózní projekt na sekvenování genomů 1,5 milionu kopů

Minulý týden oficiálně zahájilo Globální konsorcium vědců projekt Earth BioGenome. Jak uvádí Kate Kellandová z agentury Reuters, podporovatelé nazývají rozsáhlou iniciativu příští „měsíční snímek pro biologii“. Předpokládá se, že bude stát 4, 7 miliardy dolarů, a jeho cílem je posloupnost DNA 1, 5 milionu známých eukaryotických nebo složitých druhů života na Zemi. . Vědci říkají, že mít mapu DNA tolika druhů změní to, co víme o biologii, ekologii a biologické rozmanitosti.

Podle tiskové zprávy tento projekt začíná novým úsilím Institutu Wellcome Sanger, nazvaného Projekt Darwin Tree of Life, jehož cílem je posloupnost všech 66 000 eukaryotických druhů nalezených ve Velké Británii během příštích deseti let. Celkem se do projektu přihlásilo 17 institucí po celém světě, včetně Smithsoniana, a v blízké budoucnosti nastíní své plány.

V současné době vědci sekvenovali pouze genomy asi 3 500 druhů komplexního života a pouze asi 100 bylo sekvenováno v „referenční kvalitě“, která se používá pro hloubkový výzkum. Přidání desítek tisíc genomů na tento seznam není ničím revolučním.

"Mluvíme o nových lécích, nových palivech pro budoucnost, " řekla Julia Wilson ze společnosti Sanger Trust Victoria Gill v BBC. "V tuto chvíli jsme omezeni našimi představami - nedokážeme si ani představit, co nám to řekne."

Ambiciózní myšlenka se poprvé sešla v roce 2015 na setkání vedeném Harryem A. Lewinem, Kalifornská univerzita, Davis, významný profesor evoluce a ekologie; Gene Robinson, ředitel Institutu genomické biologie Carl R. Woese z Illinois University; a W. John Kress, výzkumný botanik a kurátor v Smithsonianově Národním muzeu přírodní historie.

Vědci byli inspirováni projektem Human Genome Project. Zatímco historické řazení lidského genomu v roce 2003 trvalo více než deset let a stálo v té době zhruba 3 miliardy dolarů (což, pokud vezmete v úvahu inflaci, by stálo odhadovaných 5 miliard $ t0 den), masivní úsilí dramaticky snížilo náklady na sekvenční služby. To staví tento masivní projekt do říše možností.

Po dokončení se předpokládá, že projekt Earth BioGenome vyprodukuje exabyte dat nebo 1 miliardu gigabajtů, které budou sdíleny online zdarma.

Je těžké říci, k čemu povede mapování genů. "Mezery v našich znalostech jsou mnohem větší než to, co víme, " říká Lewin BBC. "Takže ani nevyplňujeme kousky skládačky;" většina hádanek je prázdná. “

Ale jak Jim Smith, ředitel vědy ve Wellcome Trust, zdůrazňuje, že totéž platí, když vědci poprvé začali pracovat na projektu Human Genome Project před čtvrtstoletím. "Nedokázali jsme si představit, jak by DNA sekvence vytvořená tehdy mohla dnes transformovat výzkum na lidské zdraví a nemoci, " říká Smith. "Pustit se do mise, která by sledovala celý život na Zemi, se neliší."

Ambiciózní projekt na sekvenování genomů 1,5 milionu kopů